MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. MCS chromosome

Total Repeats: 155318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008146	CCG	2	6	145388	145393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_008146	GGC	2	6	145465	145470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_008146	GT	3	6	145512	145517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008146	GGA	2	6	145566	145571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_008146	GCG	2	6	145604	145609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4006	NC_008146	GAA	2	6	145613	145618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108797110
4007	NC_008146	TGC	2	6	145622	145627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4008	NC_008146	GTCACC	2	12	145638	145649	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108797110
4009	NC_008146	CCG	2	6	145732	145737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797110
4010	NC_008146	GCAA	2	8	145760	145767	50 %	0 %	25 %	25 %	108797110
4011	NC_008146	GCC	2	6	145797	145802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797110
4012	NC_008146	GGC	2	6	145880	145885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4013	NC_008146	GCT	2	6	145940	145945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4014	NC_008146	GACC	2	8	145946	145953	25 %	0 %	25 %	50 %	108797110
4015	NC_008146	TCG	2	6	145960	145965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4016	NC_008146	CCT	2	6	145967	145972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108797110
4017	NC_008146	CGG	2	6	145973	145978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4018	NC_008146	CGC	2	6	145994	145999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797110
4019	NC_008146	GC	3	6	146008	146013	0 %	0 %	50 %	50 %	108797110
4020	NC_008146	GTT	2	6	146036	146041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108797110
4021	NC_008146	GCT	2	6	146096	146101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4022	NC_008146	GCT	2	6	146198	146203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4023	NC_008146	TGG	2	6	146314	146319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108797110
4024	NC_008146	CAT	2	6	146327	146332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108797110
4025	NC_008146	CCT	2	6	146345	146350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108797110
4026	NC_008146	CTCAAC	2	12	146370	146381	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	108797110
4027	NC_008146	CGGC	2	8	146452	146459	0 %	0 %	50 %	50 %	108797110
4028	NC_008146	GCG	2	6	146503	146508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4029	NC_008146	GCT	2	6	146537	146542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4030	NC_008146	TGC	2	6	146557	146562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4031	NC_008146	TGT	2	6	146566	146571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108797110
4032	NC_008146	TGC	2	6	146572	146577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4033	NC_008146	CG	3	6	146589	146594	0 %	0 %	50 %	50 %	108797110
4034	NC_008146	CGG	2	6	146597	146602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4035	NC_008146	CGCC	2	8	146609	146616	0 %	0 %	25 %	75 %	108797110
4036	NC_008146	GCG	2	6	146680	146685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4037	NC_008146	CGG	2	6	146699	146704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4038	NC_008146	GCA	2	6	146756	146761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4039	NC_008146	GCT	2	6	146804	146809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4040	NC_008146	CGG	2	6	146821	146826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4041	NC_008146	TCG	2	6	146827	146832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4042	NC_008146	TGG	2	6	146869	146874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108797110
4043	NC_008146	GTC	2	6	146916	146921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4044	NC_008146	GGC	2	6	146922	146927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4045	NC_008146	CGCTGC	2	12	146983	146994	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	108797110
4046	NC_008146	CTG	2	6	147030	147035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4047	NC_008146	AGC	2	6	147087	147092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4048	NC_008146	GTG	2	6	147117	147122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108797110
4049	NC_008146	ACG	3	9	147133	147141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4050	NC_008146	ACT	2	6	147145	147150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108797110
4051	NC_008146	CGA	2	6	147170	147175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4052	NC_008146	CGC	2	6	147254	147259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797110
4053	NC_008146	GCT	2	6	147329	147334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4054	NC_008146	CGG	2	6	147365	147370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4055	NC_008146	CGG	2	6	147374	147379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4056	NC_008146	CGA	2	6	147422	147427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4057	NC_008146	CGG	2	6	147434	147439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4058	NC_008146	CGA	2	6	147485	147490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4059	NC_008146	CGG	2	6	147521	147526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4060	NC_008146	GAC	3	9	147552	147560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4061	NC_008146	CGA	2	6	147668	147673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4062	NC_008146	GGA	2	6	147677	147682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108797110
4063	NC_008146	GAC	2	6	147714	147719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797110
4064	NC_008146	CCG	2	6	147757	147762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797110
4065	NC_008146	CCG	2	6	147769	147774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797110
4066	NC_008146	CCG	2	6	147787	147792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797110
4067	NC_008146	GCG	2	6	147847	147852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797110
4068	NC_008146	GCC	2	6	147864	147869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797110
4069	NC_008146	GCCA	2	8	147922	147929	25 %	0 %	25 %	50 %	108797111
4070	NC_008146	GTC	2	6	147957	147962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797111
4071	NC_008146	CGA	2	6	147983	147988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797111
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4073	NC_008146	GCG	2	6	148057	148062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797111
4074	NC_008146	CGG	2	6	148070	148075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797111
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4079	NC_008146	CAGCAC	2	12	148188	148199	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	108797111
4080	NC_008146	CGC	2	6	148200	148205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797111
4081	NC_008146	CG	3	6	148212	148217	0 %	0 %	50 %	50 %	108797111
4082	NC_008146	GGC	2	6	148232	148237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797111
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4084	NC_008146	CACT	2	8	148372	148379	25 %	25 %	0 %	50 %	108797111
4085	NC_008146	GCC	2	6	148454	148459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797111
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4088	NC_008146	CGG	2	6	148676	148681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797111
4089	NC_008146	CTG	2	6	148704	148709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797111
4090	NC_008146	GTGGG	2	10	148712	148721	0 %	20 %	80 %	0 %	108797111
4091	NC_008146	CGG	2	6	148751	148756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797111
4092	NC_008146	GCGCGG	2	12	148766	148777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797111
4093	NC_008146	CGG	2	6	148796	148801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797111
4094	NC_008146	CCGG	2	8	148820	148827	0 %	0 %	50 %	50 %	108797111
4095	NC_008146	AGC	2	6	148834	148839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797111
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4103	NC_008146	CGA	2	6	149153	149158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797111
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4107	NC_008146	CG	3	6	149225	149230	0 %	0 %	50 %	50 %	108797111
4108	NC_008146	GCC	2	6	149236	149241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797111
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4116	NC_008146	CCG	2	6	149444	149449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797111
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4118	NC_008146	GCGG	2	8	149466	149473	0 %	0 %	75 %	25 %	108797111
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4242	NC_008146	ATG	2	6	153861	153866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4362	NC_008146	TGG	2	6	158277	158282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108797120
4363	NC_008146	TCG	2	6	158331	158336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797120
4364	NC_008146	GTT	2	6	158380	158385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108797120
4365	NC_008146	CGA	2	6	158425	158430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797120
4366	NC_008146	GCT	2	6	158502	158507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797121
4367	NC_008146	CGA	3	9	158574	158582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797121
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4369	NC_008146	CCGGC	2	10	158642	158651	0 %	0 %	40 %	60 %	108797121
4370	NC_008146	GCT	2	6	158655	158660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797121
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4372	NC_008146	CGGA	2	8	158793	158800	25 %	0 %	50 %	25 %	108797121
4373	NC_008146	CCA	2	6	158819	158824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108797121
4374	NC_008146	CCG	2	6	158855	158860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797121
4375	NC_008146	GCC	2	6	158866	158871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797121
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4379	NC_008146	GCT	2	6	159000	159005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797121
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4381	NC_008146	CAT	2	6	159033	159038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108797121
4382	NC_008146	CTGG	2	8	159084	159091	0 %	25 %	50 %	25 %	108797121
4383	NC_008146	GAG	2	6	159100	159105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108797121
4384	NC_008146	GCCC	2	8	159126	159133	0 %	0 %	25 %	75 %	108797121
4385	NC_008146	CGT	2	6	159336	159341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797121
4386	NC_008146	CGA	2	6	159372	159377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797121
4387	NC_008146	GGT	2	6	159429	159434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108797121
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4389	NC_008146	GGC	2	6	159475	159480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4390	NC_008146	GAC	2	6	159488	159493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797122
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4392	NC_008146	GGC	2	6	159571	159576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797122
4393	NC_008146	TCGA	2	8	159602	159609	25 %	25 %	25 %	25 %	108797122
4394	NC_008146	ACGT	2	8	159710	159717	25 %	25 %	25 %	25 %	108797122
4395	NC_008146	GTT	2	6	159721	159726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108797122
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4398	NC_008146	GCCA	2	8	159818	159825	25 %	0 %	25 %	50 %	108797122
4399	NC_008146	GAG	2	6	159980	159985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108797122
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4402	NC_008146	GC	3	6	160105	160110	0 %	0 %	50 %	50 %	108797122
4403	NC_008146	CGG	2	6	160122	160127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108797122
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4418	NC_008146	TGC	2	6	160685	160690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797123
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4422	NC_008146	TGC	2	6	160799	160804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797124
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4433	NC_008146	CGA	2	6	161280	161285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797124
4434	NC_008146	CCAGGC	2	12	161289	161300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108797124
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4438	NC_008146	GGC	2	6	161433	161438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4439	NC_008146	GGT	2	6	161480	161485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108797125
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4443	NC_008146	GGT	2	6	161674	161679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108797125
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4445	NC_008146	GGGC	2	8	161767	161774	0 %	0 %	75 %	25 %	108797125
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4447	NC_008146	ACGGT	2	10	161848	161857	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4448	NC_008146	CAA	2	6	161887	161892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4449	NC_008146	GCGCA	2	10	161904	161913	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4450	NC_008146	CCG	3	9	161951	161959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797126
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4470	NC_008146	CCG	2	6	162634	162639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797126
4471	NC_008146	TCG	2	6	162643	162648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797126
4472	NC_008146	TGACG	2	10	162659	162668	20 %	20 %	40 %	20 %	108797126
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4477	NC_008146	GAC	2	6	162807	162812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797126
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4480	NC_008146	CGA	2	6	162881	162886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108797126
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4482	NC_008146	TCG	2	6	162913	162918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108797126
4483	NC_008146	CGC	2	6	162919	162924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797126
4484	NC_008146	CCG	3	9	162977	162985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797126
4485	NC_008146	CCG	2	6	163012	163017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797126
4486	NC_008146	GAT	2	6	163050	163055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108797126
4487	NC_008146	GAT	2	6	163116	163121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108797126
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4491	NC_008146	CCG	2	6	163408	163413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108797126
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